La sede Antonio Machado de la UNIA se ubica en Baeza (Jaén), localidad situada a 48 kilómetros de la capital e incluida en la lista del Patrimonio Mundial de la UNESCO.
Ocupa dos edificios de enorme valor histórico y patrimonial colindantes y unidos por una zona ajardinada, en pleno conjunto histórico:
- El Antiguo Seminario Conciliar, sobrio edificio del siglo XVII plagado de vítores en su fachada; en el mismo se iniciaron y consolidaron las actividades de la UNIA en Baeza a partir de su creación en 1994. En el Seminario se encuentran el Centro Andaluz de Estudios para el Desarrollo Rural (CAEDER), la Biblioteca, el Aula de Informática, el Salón de Actos, la Residencia Universitaria, la Cafetería y otras instalaciones y servicios para la comunidad universitaria.
- El Palacio de Jabalquinto, de finales del siglo XV, exhibe una magnífica fachada del gótico isabelino e interior renacentista. El palacio completó y amplió el Campus de la UNIA en Baeza a partir del año 2004. Su cuidada restauración supuso para la universidad la concesión en 2005 del Premio Ciudades Patrimonio de la Humanidad. En el mismo se encuentran el Aula Magna, la mayoría de las aulas docentes, la dirección de la Sede y diferentes dependencias administrativas y de gestión.